Bis heute ist das Frauenkloster St. Karl ein einzigartiges Zeugnis eines blühenden klösterlichen Lebens geblieben. Die Schwestern des Klosters St. Karl haben während drei Jahrhunderten die Mädchen von Altdorf unterrichtet und haben sich damit grosse Verdienste um die Bildung erworben.
Die Kapuzinerinnen haben die Klostergemeinschaft aufgelöst und 2004 das Kloster der Stiftung übergeben.